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晶體日記(十八)- 尋找反常和有趣- X射線衍射XRD

更新時間:2024-08-28點擊次數(shù):469

突然看到飛機上的某位同學在那么努力的看文獻。敬業(yè)的精神著實很難得..幾日前講課,突然想到自己的學生和工作過往,發(fā)出也許是故作深沉的感慨:Boring again。從學校到公司,從一份工作到另一份工作,在某個時間點突然開始Boring起來。也許工作本就如此,大多數(shù)時間被無聊的事情的占據(jù)著,我們能做的無外乎自己努力地保持著Active的心態(tài)罷了。

出現(xiàn)反常

不過聽課的老師,倒是覺得20多年來,總是遇到不同的東西,不會覺得Boring。是呀,遇到新的問題,解決了,才會有成就感。但之后的體力勞動著實更加費時間??赡苡型瑢W會問我,我說的是做什么?晶體學嗎?對,我說的是結構精修… 所以,我經(jīng)常跟很多同學說,尊重下科學,尊重下幫你解決問題的老師們。可能因為你只追求好看而去挑刺的結果,給幫助你的人帶來了很多負面的情緒。其中的過程,你可能無法知道死了多少腦細胞。

在Routine的工作里,尋找反常,也許是消除這些Boring的好方式。然而大多數(shù)結果是,你在跟同學們討論這是很有趣的結果是,他的答案會是:“我不要反常,這和我的預期結果不一致,能改一改嗎?能消除嗎?"… 好吧,我又忍不住開始吐槽了…

“反常"晶體分析

近期的半年里發(fā)現(xiàn)的“反常"晶體,依舊遵循著有意思的扎堆定律。我開始想這樣的晶體是如何生長出的,自然界里是不是有相同的共生?確實近期發(fā)生的概率有點大。

也許是固定習慣思維的影響,看到這些晶體,可能一個反應是,這不就是自己PPT里的孿晶嗎?然后在繼續(xù)做的時候,就充滿了困惑了。亦或是自己仔細一點就會發(fā)現(xiàn),這只是看起來很像罷了。

因為現(xiàn)在APEX5 Determine Unit Cell的Domain功能很方便,也許在拆完一個domain之后,也就自動的讓它找第二個Domain了。然而結果會讓你大失所望,怎么不按套路來了呢?第二個Domain并沒有覆蓋到多少剩余的衍射點,而且和預想的并不符合。

難道做錯了,然而不管從哪個角度去分離衍射點,得到的結果都是這樣。

既然Domain功能并沒有達到預期,肯定是有原因的。回到起初學習的方式,按部就班的手動分離衍射點下來,并且把共有的衍射點都分配到兩組衍射點里。自然發(fā)現(xiàn)了其中的問題所在。

第二個domain 獨自定出的晶胞,與一個晶胞有相同的體積,然而β角卻幾乎是90°,接近于正交的晶胞。所以這并不是一個剛看到時以為的Twinning。自然Cell_now, Domain也都不會找到正確的結果。有意思的是,用兩個不同的晶胞都可以分別解出相應的結構,只是無法精修的更好。因為畢竟有50%的overlap。此時APEX5的Ignore功能可能會有些作用,但是完整度會缺失很多,所以并沒有解決問題。結構沒有發(fā)表,就不展示了。
接受反常,變有趣(X射線衍射XRD)

那么這個晶體是怎么回事呢?猜測下來,這可能是一個inter-grow的共生晶體,從一個共同的面上長出了兩種不同的晶型。當然也無法從晶體中剝離其中的一個。具體怎么解決這樣的問題,還在嘗試之中。如果有誰曾經(jīng)有過處理的經(jīng)驗,可以教教我。突然想起,其實5年前就遇到過了,當時只是認為學生挑錯了晶體… 好吧,看來并不是。

反常的東西,反而會變的更有趣一點。接受反常,給出合理的解釋,也許才能在Boring中找到新的感興趣的點。

-轉(zhuǎn)載于《布魯克X射線部門》公眾號

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